Благодаря очередному эксперименту в лаборатории Маюри Куроцути, из Уэко Мундо в Сэйрейтей возвращаются двое людей, давно пропавших в 78-м районе Руконгая. Подвергшийся внезапному нападению, Маюри теряет память, а Рукия Кучики получает странное письмо. Придя в место указанное в послании, Рукия также подвергается нападению и теряет память. В то же время все забывают о её существовании. Тем временем, Ичиго Куросаки в человеческом мире чувствует опасность и на некоторое время забывает Рукию. Вспомнив о ней, отправляется в магазин Кискэ Урахары, который полностью забыл Рукию, но тем не менее, помогает им переправиться в Сообщество душ.

Из Сообщества душ украдена «Королевская печать», на поиски которой отправляется капитан Тосиро Хицугая, но после сражения с ворами пропадает, поэтому в Сообществе душ объявляют его предателем и приговаривают к смертной казни. Ичиго Куросаки, Рукия Кучики, лейтенант Рангику Мацумото и Рэндзи Абараи не верят, что Тосиро способен совершить такое преступление. Они хотят очистить его имя от подозрений.

Однажды в Каракуре произошёл следующий случай. В городе появилась группа созданий, именуемых «чистыми». Рукия Кучики и Ичиго Куросаки отправились в разведку, по пути обнаружив проводника душ Сэнну. Впрочем, помимо имени её меча, никакой больше информации о ней нет. О принадлежности к какому-либо отряду она также не упоминает.

В Сообществе душ также неспокойно. В небе над Сэйрэтэй образовалась проекция мира живых. Объявлено чрезвычайное положение, проводится срочное расследование данного случая. Для некоторых проводников душ это событие послужило знаком приближающегося конца. Если баланс между Сообществом душ и реальным миром пошатнётся, оба мира могут пострадать. Тем временем, Тосиро Хицугая получает специальный приказ…

Ичиго и Сенна обнаруживают группу людей, называющих себя «Тёмными». Их лидер Ганрю одержим идеей уничтожения мира. По мере того, как сила Тёмных растёт, Ичиго и его друзьям предстоят все более тяжёлые и значимые битвы. Также неизвестно, почему Тёмные преследуют Сэнну. На всё у героев есть только час, час до конца мира. Битва между синигами и Тёмными уже началась.